Kanker: 4 gen ini membantu memprediksi hasil
Penelitian ekstensif tentang peran penekan tumor p53 menawarkan pemahaman yang lebih besar tentang mutasi genetik yang berperan dalam berbagai bentuk kanker, serta mengidentifikasi empat gen yang dapat membantu memprediksi pandangan seseorang.
Itu TP53 Gen bertanggung jawab untuk menyandikan apa yang oleh para ilmuwan disebut protein tumor p53 - penekan tumor yang dapat menghentikan sel untuk membelah dan berkembang biak terlalu cepat.
Peneliti telah menjuluki TP53 “penjaga genom” karena peran pentingnya dalam mencegah tumor dan menjaga agar pembelahan sel tetap terkendali.
Kanker manusia sering menampilkan mutasi pada TP53 gen, menyebabkan salah satu mekanisme pertahanan kritis terhadap kanker gagal.
Studi pertama yang mengidentifikasi TP53 mutasi pada kanker manusia muncul pada 1980-an dan, sejak itu, para peneliti telah mendedikasikan banyak waktu dan sumber daya untuk menjelaskan perannya dalam kanker.
Sekarang, penelitian terbesar dari jenisnya menggunakan sampel tumor dari lebih dari 10.000 pasien kanker dan mengamati 32 jenis kanker yang berbeda untuk lebih memahami peran kanker. TP53.
Larry Donehower, profesor virologi molekuler dan mikrobiologi di Baylor College of Medicine di Houston, TX, memimpin penelitian baru, yang muncul di jurnal Laporan Sel.
Telltale 4 genes dapat membantu memprediksi pandangan
Dr. Donehower dan tim menggunakan lima platform data yang berbeda untuk mengekstrak 10.225 sampel dari 32 kanker. Dengan menggunakan The Cancer Genome Atlas (TCGA), para peneliti dapat menilai secara komprehensif peran jalur p53 pada 32 kanker ini.
Dr. Donehower dan rekannya kemudian membandingkan data TCGA dengan database lain dari 80.000 mutasi genetik yang telah dikumpulkan oleh Dr. Thierry Soussi - seorang profesor biologi molekuler di Universitas Sorbonne di Paris, Prancis - selama 30 tahun.
Para peneliti menemukan itu TP53 mutasi lebih sering terjadi pada orang yang memiliki pandangan yang lebih buruk. Selanjutnya, analisis menemukan bahwa “Lebih dari 91% penderita kanker TP53 mutasi menunjukkan hilangnya kedua fungsi tersebut TP53 alel, ”atau varian gen.
Dr. Donehower menjelaskan: "Dalam beberapa gen kanker, Anda akan melihat satu salinan dari dua gen tersebut hilang atau bermutasi," tetapi "lebih dari 91 persen dari semua kanker kehilangan keduanya TP53 gen, bukan hanya satu. "
Kehilangan alel kedua, tulis penulis, terjadi oleh "mutasi, penghapusan kromosom, atau hilangnya heterozigositas copy-neutral" - yaitu, duplikasi gen. Peneliti utama juga mencatat bahwa proses terakhir ini terjadi jauh lebih sering daripada yang mereka yakini sebelumnya.
Yang penting, penelitian ini juga mengidentifikasi empat gen yang menunjukkan ekspresi berlebih pada mutan TP53 tumor. Menurut para peneliti, keempat gen ini dapat "mengetahui" apakah seorang pasien kanker memiliki pandangan yang baik atau tidak.
“Jika Anda memiliki ekspresi yang tinggi dari keempat gen tersebut, Anda memiliki pasien yang kemungkinan besar memiliki prognosis buruk […] Sebaliknya, jika pasien tersebut memiliki ekspresi yang sangat rendah dari gen tersebut, dia mungkin akan bertahan lebih lama dan memiliki prognosis yang baik. "
Dr. Larry Donehower
“Ini akan memberi Anda gambaran yang lebih baik tentang bagaimana dia akan bertahan daripada hanya mengetahui apakah dia mutan TP53 atau tidak, ”lanjut Dr. Donehower.
Akhirnya, studi tersebut sangat terkait TP53 mutasi dengan ketidakstabilan genom, sebuah temuan yang sejalan dengan TP53Peran khas sebagai "penjaga genom".
Dr. Donehower mengomentari keunikan penelitian baru tersebut, dengan mengatakan, “Sebagian besar penelitian tentang TP53 fokus pada satu jenis kanker. "
"Melihat 32 jenis kanker yang berbeda, Anda melihat bahwa pola tertentu bertahan terlepas dari jenis kankernya."
Rekan penulis studi dan direktur Genomik Kanker di Baylor College of Medicine, Dr. David Wheeler, juga mengomentari pentingnya temuan tersebut.
Dia berkata: “Sejak TP53 adalah salah satu penjaga gerbang terpenting dalam pencegahan kanker, semakin baik kita memahami gen ini, semakin baik kita dalam memahami biologi dasar kanker. Itu akan menghasilkan terapi yang lebih baik. "
