Kanker prostat: Data besar membuka 80 target obat baru
Dalam studi terbesar yang menganalisis genetika kanker prostat, para ilmuwan menemukan tidak kurang dari 80 target obat potensial baru. Proyek ini membuka jalan yang luas untuk desain perawatan baru.
Mengekstrak data genetik, pada suatu waktu, merupakan tugas yang rumit dan sangat memakan waktu.
Namun, karena teknologi terus meningkat, pekerjaan menjadi lebih cepat dan lebih murah secara signifikan.
Secara paralel, alat yang tersedia untuk menangani kumpulan data besar telah meningkat pesat.
Secara keseluruhan, ini berarti bahwa lautan informasi yang diambil dari kode genetik dapat dianalisis, dipetakan, dan digabungkan dengan relatif mudah untuk memberikan tingkat kejelasan yang baru.
Baru-baru ini, sebuah tim internasional menggunakan pendekatan analisis DNA bercabang ganda dan data besar untuk menyelidiki genetika kanker prostat. Dalam perburuan celah molekuler dalam pelindung penyakit, penelitian ini diatur oleh Institute of Cancer Research di London, Inggris Raya.
Tantangan kanker prostat
Kanker prostat adalah kanker paling umum kedua di antara pria di Amerika Serikat. Tahun ini, di AS, diperkirakan ada 164.690 kasus baru kanker prostat dan hampir 30.000 kematian akibat penyakit tersebut.
Meskipun para peneliti telah membuat kemajuan dalam memahami dan mengobati kanker prostat, masih ada sejumlah kesulitan.
Seperti yang dijelaskan oleh pemimpin studi Prof. Rosalind Eeles, "Salah satu tantangan yang kami hadapi dalam penelitian kanker adalah kompleksitas penyakit dan banyaknya cara yang berpotensi kami dapat mengobatinya."
Justine Alford, dari Cancer Research UK, menguraikan masalah lain dalam mempelajari dan mengintervensi kanker prostat.
“Hambatan utama untuk membuat kemajuan lebih lanjut melawan kanker prostat,” dia menjelaskan, “adalah kurangnya cara untuk secara akurat memprediksi bagaimana penyakit seseorang akan berkembang, sehingga sulit untuk mengetahui pengobatan mana yang terbaik untuk setiap pasien.”
Memanen data genetik
Untuk mendekati masalah dari arah baru, para peneliti mengambil informasi genetik dari 112 pria penderita kanker prostat dan menggabungkannya dengan data dari berbagai penelitian lain. Secara keseluruhan, sampel dari 930 pasien digunakan.
Menggunakan teknik data besar terbaru, tim mengumpulkan wawasan baru tentang perubahan genetik yang memicu perkembangan dan memicu kemajuan kanker prostat. Begitu mereka memahami gen mana yang terlibat, mereka dapat membuat peta protein yang dikodekan oleh gen ini.
Selanjutnya, mereka beralih ke database yang disebut canSAR, yang menggabungkan data dari studi, menerapkan pembelajaran mesin, dan membantu memberikan wawasan tentang penemuan obat.
Di situs web mereka, dapatkahSAR menjelaskan pertanyaan yang ingin dijawab database mereka: “Apa yang diketahui tentang protein, di mana kanker itu diekspresikan atau dimutasi, dan alat kimia dan model garis sel apa yang dapat digunakan untuk menyelidiki aktivitasnya secara eksperimental? Apa yang diketahui tentang obat, profil sensitivitas selulernya, dan protein apa yang diketahui dapat mengikatnya yang dapat menjelaskan bioaktivitas yang tidak biasa? ”
Para ilmuwan menemukan bahwa 80 protein yang mereka temukan adalah target obat yang potensial. Dan, 11 di antaranya ditargetkan oleh obat yang ada, dan tujuh lainnya dapat ditargetkan oleh obat yang sudah ada dalam uji klinis.
Temuan mereka dipublikasikan minggu ini di jurnal Genetika Alam.
"Studi kami menerapkan teknik mutakhir dalam analisis data besar untuk membuka banyak informasi baru tentang kanker prostat dan kemungkinan cara untuk memerangi penyakit tersebut."
Prof. Rosalind Eeles
Melihat ke masa depan
Penemuan ini akan membutuhkan studi lebih lanjut sebelum dapat digunakan secara klinis, tentu saja, tetapi mereka memberikan berbagai kemungkinan baru.
Seperti yang dijelaskan oleh rekan penulis Prof. Paul Workman, “Studi ini telah mengungkap sejumlah besar gen baru yang mendorong perkembangan kanker prostat, dan memberi kami informasi penting tentang bagaimana memanfaatkan biologi penyakit untuk menemukan pengobatan baru yang potensial. ”
Dia berharap bahwa pekerjaan mereka akan "merangsang gelombang penelitian baru tentang perubahan genetik dan target obat potensial yang telah diidentifikasi [mereka], dengan tujuan agar pasien mendapatkan manfaat secepat mungkin."
Batu sandungan lain untuk desain perawatan kanker prostat adalah cara penyakit berkembang secara berbeda pada setiap individu. Hal ini membuat lebih sulit untuk memutuskan pilihan pengobatan mana yang paling cocok untuk setiap pasien.
Dr. Alford berharap bahwa “[b] y sangat meningkatkan pemahaman kita tentang genetika di balik penyakit, […] di masa depan, pengetahuan ini dapat membantu dokter menyesuaikan perawatan dengan lebih baik untuk kanker individu, dan mudah-mudahan melihat lebih banyak orang yang selamat dari penyakit mereka. ”
Ini adalah hari-hari awal, tetapi temuan yang akan datang dari studi generasi berikutnya dapat menjadi transformatif di lapangan.
